Кафедра первоначально была создана по приказу министра высшего и среднего образования РСФСР в Северо-Западном заочном политехническом институте 18 июля 1964 г. при поддержке академика А.И.Берга. Первым заведующим кафедрой стал заслуженный деятель науки РФ д.т.н., проф. Л.П. Крайзмер.
С 1970 г. кафедрой почти четверть века руководил д.т.н., проф. В.И.Николаев. В эти годы на кафедре сформировались основные научные направления системного анализа, цифровой обработки информации, принципов построения перспективных средств вычислительной техники. С 1986 г. в связи с расширением сферы научных интересов коллектива и повышением роли вычислительной техники в стране кафедра стала называться кафедрой системотехники и ЭВМ.
Со второй половины 90-х годов кафедра перетерпела ряд организационных преобразований и последовательно носила названия: кафедра процессов управления и информационных систем (до 2001 г.) кафедра компьютерных технологий и программного обеспечения (до 2007 г.), кафедра вычислительных машин, комплексов, систем и сетей (до 2012 г.). В этот период кафедрой заведовали профессора Г.И. Анкудинов, И.А. Бригаднов, И.В. Иванова.
В 2012 г. кафедра была присоединена к Горному университету в связи с объединением Горного института с Северо-Западным заочным техническим университетом и получила настоящее название.
В настоящее время кафедру «Информационных систем и вычислительной техники» возглавляет доц., к.т.н. Е.Б. Мазаков.
На кафедре проводятся научные исследования по научной специальности 2.3.1 "Системный анализ, управление и обработка информации, статистика" по следующим основным направлениям:
- разработка математических методов анализа и синтеза информационных систем и автоматизированных систем управления;
- модели и методы интеллектуальной обработки информации и больших данных;
- извлечение, анализ, представление, хранение и обработка данных в информационных систем.