Кафедра «Системного анализа и управления» имеет более чем шестидесятилетнюю историю и со дня своего основания претерпела ряд преобразований и организационных изменений:
1960 год – образована кафедра «Автоматики и электроизмерительных приборов и устройств». Заведующим кафедрой назначен д.т.н., профессор Коузов Н.А.
1964 год – кафедра «Автоматики и электроизмерительных приборов и устройств» переименована в кафедру «Автоматики и телемеханики». Заведующим кафедрой назначен д.т.н., профессор Крайзмер Л.П., который совместно с будущим нобелевским лауреатом, доктором физ.-мат. наук, профессором Канторовичем Л.В. создают секцию кибернетики им. академика А.И. Берга при ленинградском Доме ученых им. М. Горького.
1965-1983 год – кафедрой руководит к.т.н., доцент Куропаткин П.В.
1983-1994 год – кафедрой руководит к.т.н., профессор Шамрай Б.В.
С 1995 по 2012 год кафедру возглавляет к.т.н., профессор Золотов О.И. Кафедра переименована в кафедру «Процессов управления и информационных систем» и осуществляет подготовку инженеров по специальности «Управление и информатика в технических системах».
В 1994 году образована кафедра «Теории и методов прогнозирования». Заведующим кафедрой назначен д.т.н., профессор Арефьев И.Б. Кафедра начинает подготовку бакалавров по направлению «Системный анализ и управление», а затем, с 1998 по 2007 год – и подготовку магистров по этому же направлению.
В 2007 году образована кафедра «Системного анализа и управления инновациями». Заведующим кафедрой назначен к.т.н., доцент Голик Е.С. Кафедра начинает осуществлять подготовку магистров по направлению «Системный анализ и управление».
В 2012 году, путем объединения кафедр «Системного анализа и управления инновациями», «Теории и методов прогнозирования» и «Процессов управления и информационных систем» образована кафедра «Системного анализа и управления».
С 2012 по 2018 год кафедрой руководит д.т.н., профессор Первухин Д.А. Кафедра завершает выпуск специалистов и осуществляет подготовку бакалавров и магистров по направлениям «Системный анализ и управление» и «Управление в технических системах».
С 2018 г. по 2022 год руководство кафедрой осуществляет д.т.н., доцент Ильюшин Ю.В.
С 2022 г. по н.в. руководство кафедрой осуществляет д.т.н., профессор Первухин Д.А. С 2023 года кафедра возобновляет приём на специалитет по направлениям подготовки «Системный анализ и управление» и «Управление в технических системах».